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應(yīng)用熒光顯微鏡研究了蛋白質(zhì)在氣-水界面的組裝——材料和方法
來源:上海謂載 瀏覽 1094 次 發(fā)布時(shí)間:2021-12-14
2.實(shí)驗(yàn)材料和方法
第二節(jié)一般試劑。對(duì)于所有步驟,均使用去離子水(去離子水,Mar Cor優(yōu)質(zhì)混床去離子,25°C時(shí)電阻率為18.2 MΩ3 cm)。通過在去離子水中溶解適量的NaH2PO4和NaN3,然后用1 M HCl調(diào)節(jié)pH至7.2,制備用于熒光顯微鏡的磷酸鹽緩沖鹽(PBS)溶液;在整個(gè)研究過程中,最終濃度為10 mM磷酸鹽和30 mM NaN3。PBS的離子強(qiáng)度通過添加NaCl來調(diào)節(jié)。Pluronic F-127(Invitrogen,MW~12 500)用PBS稀釋至0.010 mg/mL作為儲(chǔ)備溶液。二硫蘇糖醇(DTT)購自Fisher Scientific。
通過熒光顯微鏡對(duì)AWI處的蛋白質(zhì)組裝進(jìn)行成像。如圖1A所示,HSA-TR在一個(gè)特殊設(shè)計(jì)的密封室中成像,其中蛋白質(zhì)水相(體積10μL,厚度100-200μm)與一層厚度也為100-200μm的空氣共存。該室由聚二甲基硅氧烷組裝而成,并用聚乙二醇(MW 5000)對(duì)覆蓋玻璃進(jìn)行改性,以減少蛋白質(zhì)在固液界面上的競(jìng)爭(zhēng)吸附。(參見支持信息中的樣品室和表面改性以及圖S1。)在該室中形成的AWI與顯微鏡臺(tái)形成的XY平面平行。與之前對(duì)圓形液滴成像的嘗試相比,這有助于界面成像。通過在界面處聚焦(稱為XY平面圖像)或以0.1μm/步的步長(zhǎng)垂直于界面掃描(稱為XZ平面圖像),收集了23,30張圖像。使用Olympus IX81倒置顯微鏡獲取共焦圖像。表觀熒光圖像由耦合到奧林巴斯IX81系統(tǒng)的高光譜CCD(CRi Nuance FX)相機(jī)捕獲。物鏡(40,浸水,1.15 NA)通過使用543 nm激光或帶有530-550 nm帶通激發(fā)濾光片的汞燈激發(fā)染料,從下方對(duì)樣品溶液成像。在575-655nm范圍內(nèi)收集發(fā)射。光漂白后熒光恢復(fù)(FRAP)實(shí)驗(yàn)在同一共焦顯微鏡上進(jìn)行,帶有奧林巴斯SIM掃描儀裝置。使用100%功率的351 nm激光在AWI處對(duì)蛋白質(zhì)層的小區(qū)域進(jìn)行20 s的光漂白。使用543 nm激光(停留時(shí)間為2μs/像素)在光漂白之前、期間和之后捕獲區(qū)域的共焦圖像。使用ImageJ軟件對(duì)圖像進(jìn)行分析。31
圖1。(A)樣品室和倒置顯微鏡設(shè)置。(B-G)在AWI條件下,pH 7.2,離子強(qiáng)度=193 mM的PBS中HSA-TR的共焦圖像。(B,C)HSA-TR(0.050 mg/mL)或(D,E)HSA-TR(0.025 mg/mL)的XY平面圖像。圖像C和E使用4倍光學(xué)變焦。穿過(F)HSA-TR(0.050 mg/mL)或(G)HSA-TR(0.025 mg/mL)AWI的XZ平面圖像。比例尺:20μm。
蛋白質(zhì)標(biāo)記。商用HSA(Sigma-Aldrich)用胺反應(yīng)性熒光團(tuán)Texas Red-X琥珀酰亞胺酯(Invitrogen)標(biāo)記。首先將Texas Red-X溶解在二甲基甲酰胺(10 mg/mL)中,然后緩慢添加少量該濃縮染料溶液,同時(shí)攪拌至蛋白質(zhì)水溶液(0.1 M NaHCO3緩沖液中的2 mg/mL HSA,pH 8.3)?;旌虾笕玖吓c蛋白質(zhì)的摩爾比為10:1。用鋁箔覆蓋反應(yīng)溶液,并在室溫下連續(xù)攪拌1h。然后通過10-DG柱(Bio-Rad)運(yùn)行反應(yīng)溶液,去除未反應(yīng)的染料。用PBS洗脫標(biāo)記的蛋白質(zhì),并在4°C下,在9 krpm下,用3 kDa截止分子量離心過濾裝置(微孔)進(jìn)一步濃縮和純化30 min,并用10 kDa透析盒(Thermo Scientific)對(duì)1 L 10 mM磷酸鹽緩沖液透析1周。以牛血清白蛋白(BSA,Thermo Scientific)為標(biāo)準(zhǔn),通過Lowry分析(Thermo Scientific)測(cè)定標(biāo)記蛋白的最終濃度。紫外-可見光譜和MALDI-TOF質(zhì)譜顯示標(biāo)記的染料與蛋白質(zhì)的比率分別為1.3和1.5。(參見支持信息中的染料與蛋白質(zhì)比率測(cè)量和圖S2。)將產(chǎn)品溶液分成等份,并在-20°C下儲(chǔ)存以供進(jìn)一步使用。
染料標(biāo)記和未標(biāo)記蛋白質(zhì)的比較。通過圓二色譜(CD)光譜和表面壓力測(cè)量對(duì)HSA和HSA-TR進(jìn)行比較。將AWI處標(biāo)記或未標(biāo)記蛋白質(zhì)形成的蛋白質(zhì)層轉(zhuǎn)移到云母表面,并使用敲擊模式AFM(數(shù)字儀器)測(cè)量高度,并使用Nanoscope IIIa軟件(5.12版,數(shù)字儀器)進(jìn)行處理。
CD測(cè)量在帶有珀耳帖溫度控制器的Chirascan CD光譜儀上進(jìn)行。在10mM磷酸鹽緩沖液(pH 7.2)中,用10mM NaCl將HSA和HSA-TR稀釋至0.10mg/mL,然后轉(zhuǎn)移至0.1cm路徑長(zhǎng)度的試管中。HSA和HSA-TR的遠(yuǎn)紫外CD光譜在25°C下收集,波長(zhǎng)范圍為190-260 nm,掃描速率為0.5 nm/s,狹縫帶寬為1.0 nm。在25℃和95℃之間記錄熱變性曲線,每一步增加2℃和120 s平衡時(shí)間。使用帶有線探針微量天平的MicroTroughX-Langmuir槽測(cè)量表面壓力(Kibron,Inc.)。將10mM PBS中的HSA或HSA-TR(0.10mg/mL)用移液管移到微槽中。在AWI立即形成后1小時(shí)內(nèi)記錄表面壓力。然后,使用Langmuir-Schaefer技術(shù),通過Kibron微槽控制器,將AWI處的層轉(zhuǎn)移到新劈開的云母表面上。32使用去離子水進(jìn)行沖洗步驟,以沖洗掉樣品表面上多余的鹽。樣品在空氣中干燥,然后在空氣中使用超銳懸臂梁(NSC16,MikroMasch)在攻絲模式下通過AFM進(jìn)行研究。使用WSxM軟件(Nanotec)分析AFM圖像以確定膜厚度。33
應(yīng)用熒光顯微鏡研究了蛋白質(zhì)在氣-水界面的組裝——摘要、介紹
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